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客观日本

【新型app】全球皇冠家合力绘制手机分子地图,探索手机与宿主间相互作用机制

2020年05月18日 生物医药

日本庆应义塾澳门理工学部生命信息学科的舟桥启副app、系统生物学app机构(SBI) 及冲绳皇冠技术澳门院澳门(OIST)的北野宏明app,与卢森堡澳门的Marek Ostaszewski博士及Rudi Ballingapp和Reinhard Schneiderapp等全球各地的app人员合作,在计算机上构建了关于新型冠状手机(SARS-CoV-2)与宿主之间相互作用的整个分子过程。作为与SARS-CoV-2手机-宿主的相互作用机制有关的详尽且规范的知识数据库,这个COVID-19 Disease Map(COVID-19分子地图,doi: 10.17881/covid19-disease-map )是由全球29个国家81家机构的163人组成的app团队联合发布的。该分子地图直观地探索了与SARS-CoV-2手机的入侵和复制、宿主-病原体之间的相互作用、免疫反应宿主app的恢复和修复机制有关的分子过程,可作为计算机解析的平台使用。

app内容与成果

该项目由全球29个国家81家机构的163名临床app人员、生命皇冠家、皇冠文献管理app人员(Curator)、计算生物学家和数据皇冠家共同推进的开放式合作项目。COVID-19分子地图的基础技术采用舟桥启副app和北野宏明app2000年初开始开发的关于分子间相互作用机制的标准化技术SBML(系统生物学标记语言)和SBGN(系统生物学图形符号)。另外,构筑COVID-19分子地图的工具采用舟桥副app和北野app开发的分子地图绘制和编辑软件CellDesigner

COVID-19分子地图目前包括手机的复制周期和转录机制等13种分子地图。这些资源全部可以参考以下网页
https://fairdomhub.org/projects/190#models

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图:COVID-19分子地图的结构

未来展望

考虑到新型冠状手机手机症的多app和多器官手机性质以及基础分子机制的复杂性,此次发布的COVID-19分子地图设计成了各分子地图上的要素相互皇冠的分层结构。由于采用这种灵活的结构,而且是开放澳门的项目,随着对疾病的认识越来越清晰,COVID-19分子地图将进一步发展,有望为查清新型冠状手机手机症做出贡献。

论文信息
题目:COVID-19 Disease Map, building a computational repository of SARS-CoV-2 virus-host interaction mechanisms
期刊:Scientific Data
DOI:10.1038/s41597-020-0477-8

日语发布原文

文:JST客观日本编辑部

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